格里菲思看到的是一个更早的问题：无毒性的 R 型活菌，为什么会在某种条件下变成有毒性的 S 型活菌？按四组实验依次运行，把观察结果写进实验记录。
S 型菌有荚膜、菌落光滑、有毒性；R 型菌无荚膜、菌落粗糙、无毒性。
只给小鼠注射无毒性的 R 型活菌。
只给小鼠注射有毒性的 S 型活菌。
S 型菌已被加热杀死，失去增殖能力。
把两种成分混合后再注射。